La torre di Portonovo fu realizzata nel 1716 su commissione di papa Clemente XI, al fine di consentire ai soldati di controllare l'intera costa circostante.
Nel 1810, durante il Regno d'Italia di Napoleone, la torre è stata affiancata dal fortino napoleonico, realizzato su commissione del generale Eugène de Beauharnais.
La funzione militare di entrambe le strutture viene meno con l'entrata delle Marche nel Regno d'Italia, ma ne consegue il definitivo abbandono.
La torre e il fortino che noi oggi possiamo ammirare in tutto il loro splendore, è il risultato di un lungo restauro avvenuto negli anni sessanta.